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A B C D E F 123456981 Pond Newts_present Adult_newt_present Larval newt present Fish_present Depthclass G Conductivity H J K L M N O
A B C D E F 123456981 Pond Newts_present Adult_newt_present Larval newt present Fish_present Depthclass G Conductivity H J K L M N O P Q alkalinity HER001 LIE001 LIE002 100 2 0 0 5 LIE003 1 1 6 LIE004 1 1 7 LIE005 0 0 TOL002 1 1 9 WET 001 1 2 10 WET 002 0 0 200OOOONO 0 1 368 0 0 0 0 0 0 32333- 217 0 80 2 554 0 100 634 0 75 577 0 0 798 0 100 0 1 718 0 60 0 3 120 0,131147541 30 1 2 61 0 75 11 WET 003 1 1 0 0 2 155 0,125 100 12 13 123 WET 004 0 0 0 0 2 172 0,223684211 100 WET 005 1 1 1 1 1 202 0,071428571 60 14 WET 006 1 1 0 0 1 135 0,051724138 100 15 WET 007 1 1 1 0 2 122 0,20754717 75 16 17 18 19 61890 DIE 001 DIE 002 DIE 003 DIE 005 20 DIE 006 22222222 1234567 21 22 KOL 001 KOL 002 23 KOL 003 24 KOL 004 25 KOL 005 26 MEE 001 27 MEE 002 28 MEE 013 001001000 OOOO 0 0 0 1 188 0 30 0 0 0 1 197 2 2 0 1 473 0 0 0 1 111 0 0 0 2 175 1 1 0 2 84 0 0 0 1 140 O o O o O o 0 40 0 30 0 60 0 100 0 10 20 0 0 1 1 855 0 60 0 0 0 1 587 0,037735849 100 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2222 735 602 322 357 O o O o 0 35 0 50 0 0 0 0 200000025003022222032oooooo 250000252002002125062000000 openwater. ergentvegetatibmergvegetatioatingvegetatic Grassland. Shrubland. 50 0 Forest. Farmland % Waterclarity cla 10 40 0505005 Goooooo220000200000 15 100 0 25 0 100 0 15 0 40 20 80 100 100 50 75 100 40 70 25 75 30 0 90 0 80 90 40 70 70 65 100 40 2020021220055032020220300 75 75 002802050000 75 75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40 40 0 70 30 0 20000 ogoo 200 0300620 25 4 R NH4 0,491269841 4 0,491269841 3 0,491269841 3 0,491269841 3 0,491269841 0 1 0,491269841 40 3 0,491269841 0 4 0,04 0 3 0,07 0 1 0,07 0 1 0,06 0 3 0,14 4 0,14 4 0,05 4 0,15 4 0,09 0 4 0,1 0 1 0,06 0 1 2,64 0 4 0,02 3 0,04 2 0,61 1 0,03 4 0,02 232 1,38 0,3 0,05 R S T U V W X Y Z AA AB AC AD AE AF AG AH AJ AK 1 NH4 NO2 NO3 NPOC Total_N PO4 BrO3 Ca CI F K Mg Na SO4 As Ba Cd Cr Cu 2 ,491269841 0,014920635 0,094 30,5 2,4 0,19 0 57 30 0 0,94 7,8 18 34 32 4,1 24 0 0 0 3,491269841 0,014920635 0 16,1 1,2 0,28 0 33 10 0 2,8 5,2 8,9 8,5 27 2,9 3 0 0 0 4,491269841 0,014920635 0 15,7 3,5 2,95 0 100 27 0,23 3,1 6,4 21 50 37 1,6 11 0 0 0 5,491269841 0,014920635 0 21,3 3,3 1,99 0 110 45 0 5,7 9,8 23 48 59 1,7 20 0 0 0 6 491269841 0,014920635 0 16,8 2,1 1,42 0 79 46 0 3,5 9,6 45 90 47 2 7,491269841 0,014920635 8,491269841 0 48,9 8,7 9,04 0 140 36 0 25 9,8 23 150 40 3,4 0,014920635 0 12,9 4,8 0,52 120 48 0,24 5,3 22 15 2,1 13 1,9 9 0,04 0 0 7,3 0,2 0,14 0 15 3,4 0,19 5,4 3,6 4,5 0,15 70 5,9 10 0,07 0 0,15 16,7 2,766666667 0,69 0 6,9 1,7 0,14 3,9 0,96 2,6 0,25 154 4,1 11 0,07 0,01 0 49,1 2,766666667 1,36 0 21 14 0,24 6,3 1,9 10 5,5 135 7 12 0,06 0 0 76,5 2,766666667 0,99 0,024 27 10 0,33 1,3 4 9 1,8 112 9,3 13 0,14 0 0 25,6 2,766666667 0,44 0 28 13 0 4,2 5,1 9,8 4,2 528 5,1 14 0,14 0,01 0 8,0 2,766666667 0,26 0,021 20 5,3 0,23 5,9 1,8 3,3 2,7 763 2,5 15 0,05 0 0,093 9,7 2,766666667 0,08 0,033 19 5,3 0,33 6,9 1,1 2,4 1,5 716 1,6 16 0,15 0,01 0,083 24,9 2,766666667 0,57 0 18 21 0 3,8 3,4 12 41 117 6,3 17 0,09 0,01 0,1 19,4 2,766666667 0,43 0 19 17 0 8,2 4,6 11 43 414 4,1 252752511521 47 0 0 2 0,1 1 1 43 0 0 0 0 0 1 0 0 2 20 0,1 0 4 0 0 1 31 0 14 0 0 1 0 1 34 0,2 2 18 0,1 0 0,029 11,0 2,766666667 0,27 0 47 66 0,56 3,5 8,5 47 19 0,06 0,02 0 69,4 2,766666667 0,98 0 16 8 0 1,5 1,4 6,5 20 2,64 0,05 0,047 67,2 2,766666667 0,67 5,3 17 0 27 2,7 10 16 21 0,02 0,01 0 13,6 2,766666667 0,05 11 0,82 0 0,71 2,8 3,2 22 0,04 0 0 26,3 2,766666667 0,14 0 27 4,4 0,092 1,4 6,2 5,4 23 0,61 0,01 0 38,2 2,766666667 10,72 0 120 95 0,37 16 18 57 29 2222 24 0,03 0,01 0,036 49,2 2,766666667 1,55 100 41 0,33 14 11 22 29 25 26 27 569 0,02 0 0 15,5 2,766666667 8,96 0 140 41 0 6,4 12 32 1,38 0,01 0,041 40,5 2,766666667 9,28 0 110 29 0,37 12 9,3 14 0,3 0,02 0 25,9 2,766666667 3,39 44 22 0 18 5 11 37 2266222633 47 2,7 27 0 0 20 1233 3 21 0 3 1646 4,3 17 0 5 8,6 13 1 4 0 0 3,5 12 2 9 0 0 71 13,5 19 0 0 208 11,3 55 0 0 16 25 3,1 29 0 0 9,3 111 14,7 90 0 1 1524 4,3 41 0,1 3 453220 + 3011-223 2 4 > model1 summary(model1) Generalized linear mixed model fit by maximum likelihood (Laplace Approximation) ['glmerMod'] Family: binomial ( logit ) Formula: Newts_present Data: GCN_good ~ Fish_present * Waterclarityclass + (1 | Waterclarityclass) logLik deviance df.resid AIC 78.9 BIC 89.8 -34.5 Scaled residuals: Min 1Q Median 3Q 68.9 Max 60 -2.3070 -0.5016 0.4335 0.7209 2.5012 Random effects: Name Waterclarityclass (Intercept) 1.911e-16 1.382e-08 Groups Number of obs: 65, groups: Fixed effects: Variance Std. Dev. Waterclarityclass, 4 Estimate Std. Error z value Pr(>Izl) (Intercept) Fish_present Waterclarityclass -2.3972 -0.1044 1.0173 Fish_present: Waterclarityclass -0.6832 0.9401 -2.550 2.6011 -0.040 0.0108 * 0.9680 0.0018 ** 0.4896 0.3259 3.121 0.9888 -0.691 Signif. codes: 0 ***** 0.001 **** 0.01 *** 0.05' Correlation of Fixed Effects: (Intr) Fsh_pr Wtrclr Fish_presnt -0.361 Wtrclrtycls -0.940 0.340 Fsh_prsnt: W 0.310 -0.946 -0.330 optimizer (Nelder_Mead) convergence code: 0 (OK) boundary (singular) fit: see help('isSingular') ' 0.1' ' 1 Fixed effects: (Intercept) Fish_present Estimate Std. Error z value Pr(>Izl) -2.3972 -0.1044 0.9401 -2.550 0.0108 * 2.6011 -0.040 0.9680
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